抗原一般都是蛋白質，其中某一小段胺基酸(6個以上)具有特別的立體結構(蛋白質的三級結構)，稱為“抗原決定基”，抗原決定基能夠讓生物體的巨噬細胞辨識出來，并且引發生物體產生抗體。一個抗原可能有數個抗原決定基，每個抗原決定基都會引發一種抗體，如**圖16-3(a)所示，左邊的抗原決定基是方形，就會引發生物體產生方形結合端的抗體；上面的抗原決定基是圓形，就會引發生物體產生圓形結合端的抗體；右邊的抗原決定基是尖形，就會引發生物體產生尖形結合端的抗體。